Isä Malakain silmät on psykologinen riivaustarina, jossa demoniset voimat tulevat pelottavan lähelle. Ahdistuskohtauksista kärsivä Anton Lavio hakee apua Isä Malakailta, entiseltä jesuiitalta ja katolisen kirkon manaajalta. Isä Malakai on kirkosta erottamisensa jälkeen erikoistunut manaamaan demoneita ihmisiin, jotka tarvitsevat inspiraatiota ja itsevarmuutta elämässään. Palvelulla on kuitenkin hintansa.
Teinityttö saa outoja ja uhkaavia viestejä tuntemattomalta ahdistelijalta, ja tapahtuu hirvittävä veriteko. Samoihin aikoihin psykoterapeutti Daniel Kajo auttaa vanhaa poliitikkoystäväänsä pääsemään eroon kiusallisesta fobiasta. Kun eräs ilta päättyy katastrofiin, Daniel ja Anne välttyvät skandaalilta vain sen ansiosta, että kolmas vanhasta ystäväporukasta ottaa yhteyttä ja lupaa hoitaa asian. Palvelukselle on kuitenkin yksi ehto. Pian he huomaavat, että jotain hirvittävää tapahtui jo heidän nuoruudessaan ja että heidän teoillaan on nyt kammottavia vaikutuksia.
